Sídlo imunologie se nachází ve spodní části areálu ústecké Masarykovy nemocnice. Imunologické pracoviště bylo a stále je vnímáno jako jedno z významných v republice. Ústecká pobočka imunologického pracoviště je jediná v Čechách, kromě Moravy, která se zabývá bakteriální imunomodulací (vyrábí se zde „na míru“ vakcíny pro zlepšení imunity pacientů). Na to vše mají zaměstnanci zdravotního ústavu špičkové a moderní přístroje a vybavení.

Oddělení laboratorní imunologie má na starost komplexní imunologickou laboratorní diagnostiku v oboru „alergologie a klinická imunologie” a dalších medicínských oborech (interna, pediatrie, infekce, revmatologie, neurologie, gastroenterologie, ORL, dermatovenerologie, onkologie atd.). Poskytuje široké spektrum vyšetření v oblastech humorální a buněčné imunity, likvorologie, imunologicky podmíněné neplodnosti, antiinfekční imunity a vakcinace či molekulární biologie.